iPSYCHs ledelsesgruppe er sat sammen af seks forskningsledere og ledet af den videnskabelige direktør. Gruppen koordinerer og tager overordnede beslutninger vedrørende projektet. Det er den videnskabelige direktør, som har dataansvar, mens iPSYCHs direktør har ansvar for projektets fremskridt og resultater. Det er også direktøren, der har kontakten til Lundbeckfonden.

Ledelsesgruppen består af:

Professor Merete Nordentoft, professor Anders Børglum, professor og videnskabelig direktør Preben Bo Mortensen, professor Thomas Werge, professor Ole Mors, direktør David M Hougaard og direktør Kristjar Skajaa.